Con respecto a polimorfismos genéticos que determinan mala metabolización de la cafeína (gen CYP1A2), tenemos que considerar no solamente al café sino también otras fuentes de cafeína, como el chocolate. El contenido de cafeína del chocolate es mucho menor que el de los granos de café pero es también una fuente concentrada de ese constituyente psicoactivo. Individuos muy sensibles y aquellos con trastornos del ritmo cardíaco, pueden tener efectos adversos de la cafeína del chocolate. Pero, en general, el chocolate oscuro (contenido de cacao de al menos 60 %), no ligado con leche, es muy saludable. Particularmente, mejora los factores de riesgo cardiovascular y de la presión arterial, incluso en el embarazo, protege la función cognitiva.